飞秒的操作时间不是太长，10分钟左右就可以完成操作。然而手术前头可能会有些列队韶华，有的卫生站安排下半晌手术会颇具较多的人，根据排队底顺序一个接着一个，因而存有等待之年月。手术前的准备也需要一些时间，真正的手术从手术台到完成只需要10分钟左右，不用太担心。手术中不会有疼痛，飞秒手术后反应比较轻微，即使不是太严重，也不会有明显的失明、疼痛或异物感等症状。所以，只要安心地听从医生的指示就行了。
然而，飞秒手术后的恢复时间会受到许多因素的影响，如疾病的实际情况、手术的大小、个人的身体状况等。为了对化学进行分析，不能一概而论，通常需要一个月左右的时间恢复。手术后要多注意用眼习惯，不要让眼睛累了，不要长时间看电视、看电脑、看书看报纸。不利于眼睛的恢复，可以每天按摩眼睛，也可以采取热敷的方式缓解不适。
飞秒手术长项：
大幅增加手术高风险
在传统的板层刀手术中，如果在刀片旋转过程中发生负压环松动等事故，角膜瓣的制造将彻底失败，手术只能在3个月后进行。这给患者和医生带来了巨大的心理压力。如果同样的事故也发生在《飞秒激光》手术中，医生只需再次戴上负压环，在不中断手术的情况下，立即补充激光即可。因为用飞秒激光制作角膜瓣时，只会产生一些水泡和气泡来推开角膜组织，因此不会对组织造成损害，而且可以在同一受影响的区域进行多次手术。安全性大大降低。同时值得注意的是，过高的负压会损伤眼底，片状刀的负压较低，飞秒激光的负压最低的是Ziemer LDV飞秒激光器。
复位更高精度
板层刀是横切的，眼球表面是球形的，所以角膜瓣的轮廓呈“杯盖”状，与眼球基质的固定不够好。而利用飞秒激光制作的角膜瓣，则与眼球基质形成了一层埋藏在一起的遮挡物--地下井盖。整复方便紧凑，无脱位，不会出现断瓣、纽扣瓣等并发症。同时，其激光光源还避免了使用叠片刀具可能造成的金属残留物。
幸免医源性感染
为了降低LASIK手术成本，很多小型激光眼科机构并不严格执行一人一刀的原则，重复使用一次性手术刀。大大增加了交叉感染等医疗风险，“飞秒激光”在角膜手术中远离板层刀，避免了手术过程中的交叉感染。
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